自動化與電氣工程學院成立于2000年12月。源于1958年的船舶電氣管理專業和控制工程專業，具有40多年的發展歷史，電氣工程及其自動化專業的船舶電氣管理方向學士學位于1979年獲得英國輪機工程學會的認可并注冊。學院設有五個教研室，一個研究所，一個公司，即：自動控制教研室、船舶電氣工程教研室、微機控制教研室、電子技術教研室、有控制理論與控制工程、電力電子與電力傳動兩個碩士學位授予專業。有"控制工程"工程碩士學位授予權。"控制理論與控制工程"博士點、"檢測技術與自動化裝置"和"電力系統自動化"兩個碩士點正在建設中。學院還參與輪機工程博士點的共建。目前，本科、碩士、博士各類在校生700多人。本科學制四年，今年共招收本科威240名。
本學院師資力量雄厚，教學管理完善，科研開發活躍。全院有教職工72人，其中教授11人，副教授23人。高級工程師4人，高級實驗師3人。學院教師結構合理，具有較高的學術水平和教學水平，治學嚴謹，學術氛圍濃厚。近年來，出版各類學術專著5部，在國內外學術刊物上發表研究論文數百篇。與國內外同行建立了廣泛的學術交流與聯系。
學院大力開展科學研究、技術開發等科研工作，學院每年承擔了國家級、省部級科技攻關等科研課題和企業委托的科研課題二十多項，近年來，多次獲得省部級科技進步獎。學院重視對學生實踐能力和創新能力的培養。2003年在全國大學生"挑戰杯"技術競賽和"電子設計"大賽中均獲得很好成績。
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